Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ctu1Q99J10 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ctu1Q99J10 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ctu1Q99J10 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ctu1Q99J10 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ctu1Q99J10 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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