Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdgfdQ925I7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms