Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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