Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd1Q923L3 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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