Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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Trim59Q922Y2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim59Q922Y2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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