Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atl3Q91YH5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms