Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp3Q91W36 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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