Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smg8Q8VE18 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Smg8Q8VE18 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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