Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms