Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Top1mtQ8R4U6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms