Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vmn1r200Q8R281 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Vmn1r200Q8R281 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Vmn1r200Q8R281 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r200Q8R281 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Vmn1r200Q8R281 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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