Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
OptnQ8K3K8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms