Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms