Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Abcf3Q8K268 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Abcf3Q8K268 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Abcf3Q8K268 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Abcf3Q8K268 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Abcf3Q8K268 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Abcf3Q8K268 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Abcf3Q8K268 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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