Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cmc2Q8K199 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cmc2Q8K199 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms