Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phc3Q8CHP6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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