Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

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Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tshz3Q8CGV9 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tshz3Q8CGV9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms