Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Slc38a2Q8CFE6 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms