Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Hpf1Q8CFE2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hpf1Q8CFE2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Hpf1Q8CFE2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hpf1Q8CFE2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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