Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx8Q8CFD4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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