Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdkl1Q8CEQ0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms