Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm9955Q8CEJ8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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Gm9955Q8CEJ8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Gm9955Q8CEJ8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Gm9955Q8CEJ8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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