Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc28aQ8CEI3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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