Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nup88Q8CEC0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nup88Q8CEC0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms