Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms