Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Znf428Q8C1M2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf428Q8C1M2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms