Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ube3dQ8BX13 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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