Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rbbp5Q8BX09 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rbbp5Q8BX09 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rbbp5Q8BX09 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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