Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmod1Q8BVA4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms