Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Pggt1bQ8BUY9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms