Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp1Q8BJQ2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp1Q8BJQ2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp1Q8BJQ2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp1Q8BJQ2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp1Q8BJQ2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp1Q8BJQ2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp1Q8BJQ2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp1Q8BJQ2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp1Q8BJQ2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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