Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms