Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H2-M10.4Q85ZW8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms