Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pnma8aQ80VM8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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