Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NischQ80TM9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NischQ80TM9 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms