Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Dsg1bQ7TSF1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms