Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms