Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LnpkQ7TQ95 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms