Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD3

Robo2, Roundabout homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo2Q7TPD3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Robo2Q7TPD3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Robo2Q7TPD3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms