Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim12Q78RX3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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