Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1cQ76I25 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms