Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ccdc88cQ6VGS5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms