Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmeff1Q6PFE7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmeff1Q6PFE7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms