Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms