Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smchd1Q6P5D8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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