Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrimpolQ6P1E7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrimpolQ6P1E7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms