Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Atg9bQ6EBV9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Atg9bQ6EBV9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9bQ6EBV9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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