Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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