Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Pkp4Q68FH0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Pkp4Q68FH0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pkp4Q68FH0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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