Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sptbn2Q68FG2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms